MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Sulfolobus islandicus L.D.8.5 plasmid pLD8501

Total Repeats: 223

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013770	AT	3	6	65	70	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013770	TAG	2	6	139	144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013770	TTGA	2	8	188	195	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013770	ATT	2	6	293	298	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013770	GTT	2	6	304	309	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013770	CTTT	2	8	315	322	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_013770	TTG	2	6	345	350	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_013770	AT	3	6	380	385	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013770	TCT	2	6	401	406	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_013770	AGG	2	6	469	474	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_013770	ATT	2	6	515	520	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013770	TTTA	2	8	544	551	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013770	TCA	2	6	560	565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_013770	TTA	2	6	699	704	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013770	TCT	2	6	717	722	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_013770	ATC	2	6	724	729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_013770	TAG	2	6	752	757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_013770	ATA	2	6	818	823	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_013770	TTCA	2	8	865	872	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_013770	GTT	2	6	903	908	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_013770	GAAA	2	8	985	992	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013770	ATG	2	6	1094	1099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013770	GAT	2	6	1117	1122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_013770	CTT	2	6	1206	1211	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_013770	T	6	6	1210	1215	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_013770	TCA	2	6	1305	1310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_013770	AG	3	6	1332	1337	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013770	A	6	6	1385	1390	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_013770	ATC	2	6	1416	1421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_013770	AGCC	2	8	1437	1444	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
31	NC_013770	GCA	2	6	1446	1451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_013770	ATA	2	6	1452	1457	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_013770	AGT	2	6	1494	1499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_013770	ATG	2	6	1533	1538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013770	TAG	2	6	1574	1579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_013770	ATA	2	6	1637	1642	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_013770	GAA	2	6	1655	1660	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_013770	AGG	2	6	1667	1672	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_013770	TGC	2	6	1688	1693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_013770	TTG	2	6	1694	1699	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_013770	ATG	2	6	1716	1721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_013770	GTA	2	6	1728	1733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013770	TTA	2	6	1734	1739	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_013770	CTGCAG	2	12	1747	1758	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_013770	ATA	2	6	1768	1773	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_013770	GTA	2	6	1789	1794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_013770	T	6	6	1810	1815	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013770	AGT	2	6	1828	1833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_013770	CTT	2	6	1863	1868	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_013770	TCT	2	6	1887	1892	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_013770	ATTT	2	8	1893	1900	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_013770	AAAG	2	8	1926	1933	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_013770	TAT	2	6	1966	1971	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_013770	TAA	2	6	2033	2038	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_013770	AGA	2	6	2049	2054	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_013770	AGGA	2	8	2075	2082	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_013770	TAT	2	6	2107	2112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_013770	T	6	6	2112	2117	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_013770	ATT	2	6	2173	2178	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_013770	TTC	2	6	2192	2197	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_013770	CAA	2	6	2260	2265	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_013770	CACC	2	8	2314	2321	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
63	NC_013770	AGA	2	6	2340	2345	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_013770	A	7	7	2354	2360	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_013770	TTAA	2	8	2368	2375	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_013770	ATT	2	6	2376	2381	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_013770	ACTT	2	8	2390	2397	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
68	NC_013770	CCT	2	6	2423	2428	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_013770	TA	3	6	2467	2472	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_013770	CGT	2	6	2478	2483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_013770	GCT	2	6	2494	2499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_013770	TGCC	2	8	2559	2566	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
73	NC_013770	ATATT	2	10	2613	2622	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_013770	TC	3	6	2631	2636	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_013770	CTA	2	6	2637	2642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_013770	T	6	6	2673	2678	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_013770	TGC	2	6	2693	2698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_013770	AATT	2	8	3466	3473	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_013770	GATA	2	8	3579	3586	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_013770	TGATA	2	10	5190	5199	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
81	NC_013770	A	6	6	5219	5224	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_013770	TCT	2	6	5228	5233	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_013770	AAG	2	6	7251	7256	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_013770	G	7	7	7302	7308	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
85	NC_013770	GGAT	2	8	7335	7342	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_013770	AGG	2	6	7392	7397	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_013770	CT	3	6	7437	7442	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_013770	CCT	2	6	7448	7453	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_013770	AAC	2	6	7464	7469	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_013770	GAG	2	6	7557	7562	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_013770	AAGAG	2	10	7577	7586	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
92	NC_013770	ACCT	2	8	7591	7598	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_013770	TAA	2	6	7655	7660	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_013770	GGA	2	6	7822	7827	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_013770	AGG	2	6	7831	7836	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_013770	TAA	2	6	7846	7851	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_013770	GTT	2	6	7875	7880	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_013770	AGG	2	6	7891	7896	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_013770	TGAG	2	8	7939	7946	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_013770	TGA	2	6	7997	8002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_013770	CAC	2	6	8007	8012	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_013770	GGAG	2	8	8059	8066	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
103	NC_013770	CCA	2	6	8099	8104	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
104	NC_013770	AGA	2	6	8123	8128	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_013770	GTT	2	6	8154	8159	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_013770	AAT	2	6	8171	8176	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_013770	TCA	2	6	8215	8220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_013770	AG	3	6	8241	8246	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_013770	CGT	2	6	8277	8282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_013770	TTG	2	6	8326	8331	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_013770	GGA	2	6	8551	8556	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_013770	CCTC	2	8	8575	8582	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
113	NC_013770	CTC	2	6	8588	8593	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
114	NC_013770	CTC	2	6	8609	8614	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
115	NC_013770	TCGT	2	8	8637	8644	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
116	NC_013770	T	6	6	8698	8703	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_013770	CTA	2	6	8721	8726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_013770	A	6	6	8757	8762	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_013770	AGTA	2	8	8779	8786	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
120	NC_013770	TTC	2	6	8873	8878	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_013770	TA	4	8	8960	8967	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_013770	CCT	2	6	9001	9006	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
123	NC_013770	TCG	2	6	9045	9050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_013770	TAT	2	6	9095	9100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_013770	TAT	2	6	9107	9112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_013770	AT	4	8	11739	11746	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_013770	TTA	2	6	11787	11792	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_013770	TA	4	8	11796	11803	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_013770	AAATT	2	10	12106	12115	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_013770	AAT	2	6	12171	12176	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_013770	ATA	2	6	14232	14237	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_013770	AAT	2	6	14255	14260	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_013770	TTA	2	6	16156	16161	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_013770	T	6	6	16225	16230	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_013770	TCT	2	6	19004	19009	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_013770	AAG	2	6	19041	19046	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_013770	A	6	6	19081	19086	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_013770	AATAT	2	10	21267	21276	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_013770	GTG	2	6	21284	21289	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
140	NC_013770	TTC	2	6	21320	21325	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_013770	TTC	3	9	21346	21354	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_013770	CTAGT	2	10	21425	21434	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
143	NC_013770	GGT	2	6	21445	21450	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
144	NC_013770	TAT	2	6	21455	21460	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_013770	ATTT	2	8	21466	21473	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_013770	GAT	2	6	21492	21497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
147	NC_013770	ATA	2	6	21529	21534	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_013770	AGA	2	6	21569	21574	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
149	NC_013770	GATA	2	8	21633	21640	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
150	NC_013770	ACA	2	6	21654	21659	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
151	NC_013770	GAT	2	6	21690	21695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
152	NC_013770	TAA	2	6	21707	21712	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_013770	TCT	2	6	21716	21721	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
154	NC_013770	ATA	2	6	21819	21824	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_013770	TTTC	2	8	21825	21832	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
156	NC_013770	A	6	6	21845	21850	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_013770	A	6	6	21857	21862	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_013770	A	7	7	21880	21886	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
159	NC_013770	TAT	2	6	21917	21922	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
160	NC_013770	ATT	2	6	21964	21969	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
161	NC_013770	A	6	6	21971	21976	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
162	NC_013770	ATA	2	6	22970	22975	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
163	NC_013770	TTC	2	6	23380	23385	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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165	NC_013770	TTA	2	6	23459	23464	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
166	NC_013770	TAAG	2	8	23511	23518	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
167	NC_013770	TTTAC	2	10	23587	23596	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
168	NC_013770	TTCT	2	8	23602	23609	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
169	NC_013770	TAT	2	6	23638	23643	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
170	NC_013770	TAA	2	6	23648	23653	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
171	NC_013770	AATA	2	8	23659	23666	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
172	NC_013770	GAG	2	6	23672	23677	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
173	NC_013770	TAA	2	6	23715	23720	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
174	NC_013770	GAATT	2	10	23743	23752	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
175	NC_013770	ATT	2	6	23805	23810	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
176	NC_013770	ATA	2	6	23826	23831	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
177	NC_013770	ATG	2	6	23850	23855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
178	NC_013770	AGA	2	6	23856	23861	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
179	NC_013770	ATA	2	6	23874	23879	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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181	NC_013770	CTC	2	6	23915	23920	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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186	NC_013770	AAC	2	6	24081	24086	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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189	NC_013770	GGTT	2	8	24573	24580	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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191	NC_013770	CTAA	2	8	24682	24689	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
192	NC_013770	A	6	6	24695	24700	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
193	NC_013770	ATT	2	6	24705	24710	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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195	NC_013770	AAG	2	6	24871	24876	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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198	NC_013770	GAA	2	6	25021	25026	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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200	NC_013770	GAA	2	6	25078	25083	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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202	NC_013770	TA	3	6	25153	25158	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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223	NC_013770	AAGA	2	8	26569	26576	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.